| 年間順位 | チーム | 勝点 | 試合 | 勝 | 引分 | 敗 | 得点 | 失点 | 得失点差 | ||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1or2 | 浦和レッズ | 62 | 30 | 19 | 5 | 6 | 70 | 39 | +31 | 111 | |
| 1or2 | 横浜Ｆ・マリノス | 59 | 30 | 17 | 8 | 5 | 47 | 30 | +17 | 143 | |
| 3 | ガンバ大阪 | 51 | 30 | 15 | 6 | 9 | 69 | 48 | +21 | 271 | |
| 4 | ジェフユナイテッド市原 | 50 | 30 | 13 | 11 | 6 | 55 | 45 | +10 | 121 | |
| 5 | ジュビロ磐田 | 48 | 30 | 14 | 6 | 10 | 54 | 44 | +10 | 222 | |
| 6 | 鹿島アントラーズ | 48 | 30 | 14 | 6 | 10 | 41 | 31 | +10 | 80 | |
| 7 | 名古屋グランパスエイト | 44 | 30 | 12 | 8 | 10 | 49 | 43 | +6 | 231 | |
| 8 | ＦＣ東京 | 41 | 30 | 10 | 11 | 9 | 40 | 41 | -1 | 130 | |
| 9 | 東京ヴェルディ１９６９ | 39 | 30 | 11 | 6 | 13 | 43 | 46 | -3 | 131 | |
| 10 | アルビレックス新潟 | 37 | 30 | 10 | 7 | 13 | 47 | 58 | -11 | 191 | |
| 11 | ヴィッセル神戸 | 36 | 30 | 9 | 9 | 12 | 50 | 55 | -5 | 281 | |
| 12 | サンフレッチェ広島 | 31 | 30 | 6 | 13 | 11 | 36 | 42 | -6 | 341 | |
| 13 | 大分トリニータ | 30 | 30 | 8 | 6 | 16 | 35 | 56 | -21 | 440 | |
| 14 | 清水エスパルス | 29 | 30 | 7 | 8 | 15 | 37 | 53 | -16 | 221 | |
| 15 | セレッソ大阪 | 26 | 30 | 6 | 8 | 16 | 42 | 64 | -22 | 272 | |
| 16 | 柏レイソル | 25 | 30 | 5 | 10 | 15 | 29 | 49 | -20 | 122 |
年間順位の１位、２位はサントリーチャンピオンシップにより決定する
2nd 第7節：大分 vs 名古屋 雷雨のため試合延期 9/26 → 11/10
2nd 第11節：新潟 vs 柏 新潟県中越地震の影響により試合延期 10/30 → 11/10